近年來，新開發出了雙鏈季銨鹽消毒劑，帶有一個親水基和兩個親油基，具有更好的成膠速性和更強的降低表面張力的能力，能增加它們的水溶性，即使在水質硬度較大的情況下也呈現出相當好的溶解性，表現出很好的穩定性。研究表明，雙鏈季銨鹽消毒劑的殺菌作用比單長鏈季銨鹽類優越，去污能力較好、耐高溫及毒性低。我國新上市產品主要有3種：百毒殺，又名雙癸基二甲基溴化銨；新潔靈消毒液，又名溴化雙（十二烷基二甲基）乙撐二銨；利爾康1210消毒劑，由雙癸基二甲基氯化銨和正烷基（50%C14、40%C12、10%C16）二甲基芐基氯化銨組成的復方消毒劑。

其分子結構可分為陽離子基團和陰離子兩部分。陽離子基團多由4個有機根與氮原子結合而成，為殺菌的有效部分。陰性離子多為鹵素、硫酸根或其他類似的陰性離子。作為消毒劑的季銨鹽類，其陽離子基團中，一般有一個碳鏈長達8～18的烷基，碳鏈短于或長于此范圍者，殺菌能力 差。

我國常用的季銨鹽類消毒劑，主要有：新潔爾滅（化學名稱為十二烷基二甲基芐基溴化銨）、潔爾滅（十二烷基二甲基芐基氯化銨）、度米芬（又名消毒寧，化學名稱為十二烷基二甲基苯氧乙基溴化銨）、消毒凈 （為十四烷基-2-甲基吡啶溴化銨）。

利用表面活性劑作為載體，在一定條件下，可將碘與聚醇醚或PVP絡合，即為廣泛使用的碘伏消毒劑，可克服碘的黃染、不易脫色的缺點。目前已經成為醫療注射、醫院外科手術的首選消毒劑。 

利用洗滌劑的增溶作用，很早以前人們就將酚類與陰離子表面活性劑混合使用。例如來蘇兒（Lysol）消毒液，即煤酚皂溶液，是以3種甲酚（Cresol）異構體（鄰位、間位、對位）為主的煤焦油分餾物（195℃～205℃ ）與肥皂配成的復方。具體配方為：甲酚500mL，植物油173g，氫氧化鈉27g，蒸餾水適量（全量1000mL）。配制時，先以植物油與氫氧化鈉制成肥皂，趁熱加入甲酚與蒸餾水。肥皂的作用是使甲酚易溶于水中，并具有降低表面張力的作用。